Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Defa6P50704 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms