Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms