Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtbP41155 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms