Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtlP38585 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtlP38585 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtlP38585 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms