Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nedd1P33215 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nedd1P33215 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nedd1P33215 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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