Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa5P28312 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms