Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms