Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms