Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P10404 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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