Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Eb1P04230 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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H2-Eb1P04230 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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H2-Eb1P04230 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Eb1P04230 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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