Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01660 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01660 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01660 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms