Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nek2O35942 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms