Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20795J3QP49 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms