Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21746J3QMM6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms