Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm21866J3QMH4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21866J3QMH4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms