Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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