Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20815J3KMI0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms