Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms