Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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