Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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