Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms