Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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