Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Psma1Q9R1P4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms