Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms