Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk1eQ9JMK2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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