Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms