Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rabgef1Q9JM13 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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