Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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