Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms