Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q9D7E4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms