Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc94Q9D6J3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms