Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms