Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sgms2Q9D4B1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgms2Q9D4B1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgms2Q9D4B1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sgms2Q9D4B1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgms2Q9D4B1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgms2Q9D4B1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgms2Q9D4B1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sgms2Q9D4B1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sgms2Q9D4B1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sgms2Q9D4B1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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