Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms