Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trappc6bQ9D289 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trappc6bQ9D289 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trappc6bQ9D289 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trappc6bQ9D289 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trappc6bQ9D289 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trappc6bQ9D289 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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