Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms