Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms