Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Elp3Q9CZX0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Elp3Q9CZX0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms