Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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