Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RTRAFQ9CQE8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms