Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms