Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sf3b1Q99NB9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms