Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gdpd3Q99LY2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms