Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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