Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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