Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptnQ8K3K8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms