Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Prpf39Q8K2Z2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf39Q8K2Z2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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