Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c1Q8K284 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms