Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Csnka2ipQ8CH19 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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