Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Bcas3Q8CCN5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Bcas3Q8CCN5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Bcas3Q8CCN5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bcas3Q8CCN5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms